Gon Freecss adalah seorang budak lelaki yang tinggal di Pulau Paus. Dia belajar dari layang-layang "Hunter", bahawa bapanya, yang diberitahu telah mati, masih hidup di suatu tempat sebagai "pemburu" yang teratas, yang mempertaruhkan nyawanya untuk mencari barang-barang yang tidak diketahui, seperti khazanah tersembunyi, curiosa, makhluk hidup eksotik, dan lain-lain . Gon memutuskan untuk menjadi pemburu profesional dan meninggalkan pulau itu. Untuk menjadi pemburu, dia mesti lulus peperiksaan pemburu, di mana dia bertemu dan berkawan dengan tiga pemohon lain: Kurapika, Leorio dan Killua. Bolehkah Gon melewati halangan yang hebat ini, peperiksaan pemburu, untuk menjadi "pemburu terbaik di dunia" dan akhirnya bertemu dengan bapanya?